《争霸艾泽拉斯》的剧情紧随在《军团再临》之后，在阿古斯之战的末尾，萨格拉斯虽然被击败但却在被封印前的最后时刻将一把巨剑刺向艾泽拉斯卡利姆多大陆的希利苏斯地区，这把巨剑不仅在地表造成了巨大的破坏，也使艾泽拉斯的星魂遭受重创。一种名为“艾泽里特”的强大物质开始从希利苏斯裂口乃至整个艾泽拉斯各处涌出。联盟与部落随即开始对这种物质展开争夺，而随后双方在阿拉希高地会面上的冲突最终演变成一场全面战争。部落占领并烧毁了暗夜精灵的家园──世界之树泰达希尔，而联盟随后也攻占了被遗忘者的主城幽暗城。随着战争进入白热化阶段，双方都开始寻找新的盟友，并将玩家分别派往赞达拉与库尔提拉斯寻求援助。
元气大伤而且急需新盟友的联盟与部落双双号召他们最伟大的英雄加入阵营。吉安娜‧普罗德摩尔返回她的家乡库尔提拉斯王国，希望再次带领他们为联盟而战。然而，她遇见的却是意见分歧的贵族与不满的人民，他们只是因为轻视吉安娜过去的作为而同声一气。在此同时，部落从暴风城监狱救出赞达拉的塔兰姬公主。塔兰姬费尽心力想说服赞达拉巨魔援助部落，然而她的父亲拉斯塔哈王却一开始就拒绝听从她的意见。尽管如此，双方阵营都成功在盟友间建立信任，阵营战役也随着新盟友加入而在赞达拉与库尔提拉斯建立据点。
随着复仇之潮展开，结合新盟军的联盟与部落再次交战…
复仇之潮
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海军总帅吉安娜‧普罗德摩尔率领联盟部队大胆进击，围攻达萨亚洛的黄金金字塔。他们秘密地炸毁大多数的赞达拉舰队，成功转移了部落在纳兹米尔沼地部队之注意力。等到部落的勇士们发觉遭到欺骗，联盟早已闯进了达萨亚洛。赞达拉的统治者，神王拉斯塔哈，选择奋战至死，也不愿把他的古老王国拱手让人。虽然联盟的攻势让赞达拉元气大伤，但随着部落夺回城市并将大工匠梅卡托克打得伤重垂危，联盟也不得不被迫撤退。
决心在战争中重占上风，大酋长希瓦娜斯‧风行者计谋对联盟进行内部破坏。她揭示了一项扭曲德瑞克‧普罗德摩尔—吉安娜死去已久的兄弟，最近复活成为亡灵—心智的计谋，将他变成一项武器，来攻击自己的家人。贝恩‧血蹄拒绝让希瓦娜斯的毒计得逞，所以他选择释放德瑞克，让他与吉安娜重逢。当希瓦娜斯发现贝恩‧血蹄违背她的命令，这名牛头人酋长即被视为叛徒而遭到囚禁。
同一时刻，越来越多的娜迦入侵者对库尔提拉斯以及赞达拉沿岸发动攻击。驱退娜迦入侵者让艾泽拉斯的勇士发现了一项失落的神兵武器：萨拉塔斯，黑暗帝国之刃。这把匕首令人疯狂的低语将一队英雄诱进了风暴邪渊，黑暗势力在此聚集，想唤醒长久以来遭受禁锢的古神恩若司。虽然威胁看似受到了控制，恩若司无数的仆役将不会有片刻歇息，直到它们的主人再次复活…
艾萨拉的崛起
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